По сути, большой разницы между ними нет, вопрос только в удобстве. Лично я пользуюсь беспроводными, с ними можно не бояться повредить кабели, «хвост» мыши ни за что не зацепится в самый неподходящий момент, да и от компа можно отсесть подальше. Единственный минус – может неожиданно сесть батарейка, но у меня всегда под рукой есть парочка запасных.